JRは普通列車はほぼ全てが禁煙、特急なども禁煙車両の割合が急増しています。新幹線も地域によりますが営業開始から全日全車禁煙が増えてきています。
JR北海道では2006年のダイヤ改正から道内完結便の全列車が全面禁煙に! JR東海道/山陽新幹線では16両中12両が禁煙車に!! 成田エクスプレス、しおさいなど房総半島方面への特急列車と、長野新幹線と比較的短い乗車時間の列車でも全面禁煙に!! また次世代のN700系では一部に喫煙所を設けるが客室内は全て禁煙とする予定となっており、列車でも喫煙者にとってはますます肩身の狭い思いをすることになっている状況です。
また列車内だけではなく鉄道駅構内でも、以前ならラッシュアワーを中心としていた禁煙タイムが全営業時間内になったりとタバコを吸う時間、場所などがどんどん狭められてきています。そしてJRだけではなく関東地方の大手私鉄でも2003年にはホームの全面禁煙化が行われました。